Penny juga pernah menjabat di antaranya menjadi Kepala Bagian Penataan Ruang pada 2000-2001 di Direktorat Penataan Ruang, Pertahanan, dan Lingkungan Hidup, Deputi Bidang Regional dan Otonomi Daerah Bapennas.
Kemudian menjadi Kepala Sub Direktorat Lingkungan Hidup periode 2001-2002.
Sesuai kebutuhan organisasi, Penny juga menjabat sebagai Direktur Perkotaan dan Perdesaan pada tahun 2002-2005 pada Deputi Bidang Regional dan Otonomi Daerah Bapennas.
Lalu, menjadi Inspektur Bidang Kinerja Kelembagaan pada 2005-2007 pada Inspektorat Utama Bapennas. Menjadi Direktur Lingkungan Hidup pada tahun 2007-2008 di Deputi Bidang Sumber Daya Alam dan Lingkungan Hidup, Bapennas
Serta menjabat sebagai Direktur Sistem dan Pelaporan Evaluasi Kinerja Pembangunan Deputi Evaluasi Kinerja Pembangunan, Bapennas pada tahun 2008-2011.
Baca Juga: Sekitar 327 Warga Negara Indonesia Ikuti Ibadah Haji 2021, Berikut Keterangannya
Setelah memperoleh gelar Insinyur Teknik Lingkungan, Penny mengambil pendidikan lanjutan dan mendapatkan gelar Master in City Planning (MCP) dari Massachusetts Institute of Techonology (MIT), Cambridge, Massachusetts, Amerika Serikat.
Ibu dari empat orang anak ini mendapatkan gelar doktoral dengan Major bidang Teknik Lingkungan, dan Minor di Urban and Regional Planning, University of Wisconsin-Madison.***